เครื่องแยกเม็ดเลือดทำงานโดยอาศัยหลัก การที่ว่า เมื่อนำเลือดใส่ในภาชนะ และทำการ หมุนเหวี่ยง จะทำให้ส่วนประกอบต่าง ๆ ของ เลือดแยกจากกัน ทั้งนี้อาศัยที่ส่วนประกอบต่าง ๆ นั้นมีความหนาแน่นไม่เท่ากัน จึงสามารถแยก
เป็นส่วน ๆ ได้เครื่องแยกเม็ดเลือดที่ใช้กันในปัจจุบันนี้มี ๒ ประเภท คือ
(๑) เครื่องแยกเม็ดเลือดที่ทำงานเป็นช่วง ๆ(Intermittent or discontinuous flow bloodcell separator)
เครื่องประเภทนี้ปล่อยให้เลือดไหลเข้าไปในภาชนะที่มีรูปคล้ายระฆังจำนวนหนึ่ง หลัง จากนั้นจึงหมุนเหวี่ยงภาชนะดังกล่าว จะทำให้ ส่วนประกอบของเลือดแยกออกเป็นส่วน ๆ จึง สามารถดูดออกไปเพื่อใช้ประโยชน์ได้เป็นส่วน ๆ คือ เม็ดเลือดแดงอยู่ชั้นนอกสุด ถัดเข้ามาคือ เม็ด เลือดขาวและเกล็ดเลือด ตามลำดับ ส่วนพลาสมา นั้นอยู่ชั้นในสุด อย่างไรก็ดี วิธีนี้ใช้เวลามาก และต้องเปลืองเลือดจำนวนค่อนข้างมากเพื่อบรรจุ ในภาชนะที่หมุนเหวี่ยง
(๒) เครื่องแยกเม็ดเลือดที่ทำงานตลอดเวลา(Continuous flow blood cell separator)
เครื่องประเภทนี้ปล่อยให้เลือดไหลเข้าไปในภาชนะที่ทำการหมุนเหวี่ยงอยู่ตลอดเวลา ใน ขณะเดียวกันก็ทำการดูดส่วนประกอบของเลือด เพื่อนำออกไปใช้งาน โดยใช้ท่อแยกกัน ซึ่งเป็นท่อสำหรับดูดเม็ดเลือดแดง เม็ดเลือดขาว เกล็ดเลือด และพลาสมา วิธีนี้เปลืองเลือดน้อย เพื่อบรรจุในภาชนะที่หมุนเหวี่ยง ในขณะ เดียวกันก็สามารถส่งเลือดเข้าไปในเครื่องและดูด ส่วนประกอบของเลือดออกจากเครื่องได้ตลอดเวลา